MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TC	5	10	483	492	0 %	50 %	0 %	50 %	148543244
2	NC_009513	A	7	7	645	651	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
3	NC_009513	AGA	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543244
4	NC_009513	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543244
5	NC_009513	CTC	2	6	688	693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543244
6	NC_009513	GTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543244
7	NC_009513	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543244
8	NC_009513	TTGCCG	2	12	763	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543244
9	NC_009513	TATT	2	8	802	809	25 %	75 %	0 %	0 %	148543244
10	NC_009513	G	7	7	813	819	0 %	0 %	100 %	0 %	148543244
11	NC_009513	TAA	2	6	944	949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543244
12	NC_009513	AAC	2	6	958	963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543244
13	NC_009513	AGA	2	6	968	973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543244
14	NC_009513	TGA	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543244
15	NC_009513	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
16	NC_009513	ATATTG	2	12	1240	1251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148543244
17	NC_009513	TATAA	2	10	1458	1467	60 %	40 %	0 %	0 %	148543244
18	NC_009513	CGG	2	6	1586	1591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543244
19	NC_009513	ACC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543244
20	NC_009513	A	6	6	1643	1648	100 %	0 %	0 %	0 %	148543244
21	NC_009513	CATT	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	148543245
22	NC_009513	AAT	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543245
23	NC_009513	GTA	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
24	NC_009513	GTA	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
25	NC_009513	TTA	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543245
26	NC_009513	GAA	2	6	2083	2088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
27	NC_009513	CTT	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543245
28	NC_009513	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543245
29	NC_009513	AAG	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
30	NC_009513	ATG	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
31	NC_009513	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543245
32	NC_009513	CTG	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543245
33	NC_009513	ACA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543245
34	NC_009513	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543245
35	NC_009513	GTTAA	2	10	2746	2755	40 %	40 %	20 %	0 %	148543245
36	NC_009513	GTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543245
37	NC_009513	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
38	NC_009513	GTA	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543245
39	NC_009513	AGA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543245
40	NC_009513	A	7	7	3262	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	148543246
41	NC_009513	GAA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543246
42	NC_009513	TTGA	2	8	3286	3293	25 %	50 %	25 %	0 %	148543246
43	NC_009513	TTA	2	6	3302	3307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
44	NC_009513	AGA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543246
45	NC_009513	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
46	NC_009513	AGC	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543246
47	NC_009513	ATG	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543246
48	NC_009513	GAT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543246
49	NC_009513	CGG	2	6	3412	3417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543246
50	NC_009513	AAGAT	2	10	3437	3446	60 %	20 %	20 %	0 %	148543246
51	NC_009513	ACC	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543246
52	NC_009513	TTA	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543246
53	NC_009513	AGTA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	25 %	0 %	148543246
54	NC_009513	TTA	2	6	3676	3681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
55	NC_009513	TAA	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543247
56	NC_009513	A	6	6	3721	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
57	NC_009513	A	6	6	3770	3775	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
58	NC_009513	ATT	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
59	NC_009513	CGC	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543247
60	NC_009513	A	7	7	3973	3979	100 %	0 %	0 %	0 %	148543247
61	NC_009513	CAA	2	6	4008	4013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
62	NC_009513	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543247
63	NC_009513	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
64	NC_009513	T	6	6	4091	4096	0 %	100 %	0 %	0 %	148543247
65	NC_009513	TGA	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
66	NC_009513	TAC	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543247
67	NC_009513	AAC	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
68	NC_009513	GAT	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
69	NC_009513	ACA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
70	NC_009513	AAC	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543247
71	NC_009513	GATT	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	148543247
72	NC_009513	TGA	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543247
73	NC_009513	ATT	4	12	4430	4441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543247
74	NC_009513	AC	3	6	4479	4484	50 %	0 %	0 %	50 %	148543247
75	NC_009513	GAC	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543247
76	NC_009513	TTAA	2	8	4557	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	148543247
77	NC_009513	AGG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543247
78	NC_009513	AAC	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543248
79	NC_009513	ATG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
80	NC_009513	TCA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543248
81	NC_009513	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
82	NC_009513	TGT	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543248
83	NC_009513	GGA	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543248
84	NC_009513	TGG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543248
85	NC_009513	CGG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543248
86	NC_009513	TGT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543248
87	NC_009513	TAC	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543248
88	NC_009513	CTT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543248
89	NC_009513	AGACTA	2	12	5667	5678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148543248
90	NC_009513	TTA	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
91	NC_009513	ATT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
92	NC_009513	GCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543248
93	NC_009513	ATT	2	6	5920	5925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543248
94	NC_009513	GGT	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543248
95	NC_009513	AGCAA	2	10	5956	5965	60 %	0 %	20 %	20 %	148543248
96	NC_009513	TTC	2	6	5991	5996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543248
97	NC_009513	TTTA	2	8	6070	6077	25 %	75 %	0 %	0 %	148543248
98	NC_009513	TGA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
99	NC_009513	ATTA	2	8	6136	6143	50 %	50 %	0 %	0 %	148543248
100	NC_009513	GCC	2	6	6253	6258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543248
101	NC_009513	TGA	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543248
102	NC_009513	ACA	2	6	6410	6415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543248
103	NC_009513	GAC	2	6	6455	6460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543248
104	NC_009513	GAAT	3	12	6768	6779	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
105	NC_009513	AAG	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543249
106	NC_009513	TTG	2	6	6921	6926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543249
107	NC_009513	TGATGG	2	12	6952	6963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148543249
108	NC_009513	GCC	2	6	6968	6973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543249
109	NC_009513	ATG	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
110	NC_009513	TTA	2	6	7112	7117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
111	NC_009513	CTA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543249
112	NC_009513	TTA	2	6	7185	7190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
113	NC_009513	AATG	2	8	7207	7214	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
114	NC_009513	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543249
115	NC_009513	AGT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
116	NC_009513	TAT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
117	NC_009513	GAA	2	6	7361	7366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543249
118	NC_009513	A	7	7	7368	7374	100 %	0 %	0 %	0 %	148543249
119	NC_009513	TAA	2	6	7417	7422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543249
120	NC_009513	TCG	2	6	7534	7539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543249
121	NC_009513	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543249
122	NC_009513	AAAG	2	8	7723	7730	75 %	0 %	25 %	0 %	148543249
123	NC_009513	TTG	2	6	7749	7754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543249
124	NC_009513	TGA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
125	NC_009513	TAAT	2	8	7791	7798	50 %	50 %	0 %	0 %	148543249
126	NC_009513	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
127	NC_009513	TGA	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
128	NC_009513	GGCA	2	8	7869	7876	25 %	0 %	50 %	25 %	148543249
129	NC_009513	GCA	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543249
130	NC_009513	AATCA	2	10	8006	8015	60 %	20 %	0 %	20 %	148543249
131	NC_009513	TGAAGA	2	12	8098	8109	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148543249
132	NC_009513	GAA	3	9	8117	8125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543249
133	NC_009513	TGA	2	6	8176	8181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
134	NC_009513	GTG	2	6	8208	8213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543249
135	NC_009513	GAT	2	6	8237	8242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
136	NC_009513	AAC	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543249
137	NC_009513	CTT	2	6	8287	8292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543249
138	NC_009513	GCT	2	6	8351	8356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543249
139	NC_009513	ATT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
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141	NC_009513	TAA	3	9	8389	8397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543249
142	NC_009513	ATG	3	9	8439	8447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543249
143	NC_009513	TAC	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543249
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150	NC_009513	GTTG	2	8	8866	8873	0 %	50 %	50 %	0 %	148543249
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153	NC_009513	ATT	2	6	8930	8935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543249
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159	NC_009513	CTA	2	6	9069	9074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543249
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162	NC_009513	A	7	7	9114	9120	100 %	0 %	0 %	0 %	148543249
163	NC_009513	TTAC	2	8	9340	9347	25 %	50 %	0 %	25 %	148543250
164	NC_009513	GAA	2	6	9366	9371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543250
165	NC_009513	TCG	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543250
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169	NC_009513	CAG	2	6	9722	9727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543251
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172	NC_009513	GTT	2	6	9934	9939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543251
173	NC_009513	TGG	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543251
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249	NC_009513	AGATG	2	10	13787	13796	40 %	20 %	40 %	0 %	148543255
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253	NC_009513	TTGA	2	8	14181	14188	25 %	50 %	25 %	0 %	148543255
254	NC_009513	ACA	2	6	14210	14215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543255
255	NC_009513	GACAA	2	10	14314	14323	60 %	0 %	20 %	20 %	148543255
256	NC_009513	TGA	2	6	14399	14404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543255
257	NC_009513	TAT	2	6	14406	14411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543255
258	NC_009513	ATA	3	9	14434	14442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543255
259	NC_009513	AAT	2	6	14451	14456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543255
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